Er zijn veel verschillende opties voor de bedekking van de bodem. Het belangrijkste is dat je een bodembedekker gebruikte welke stofvrij en veilig is voor knagers. Zaagsel is absoluut niet geschikt voor tamme ratten! Uitzondering hierop zijn de grove houtkrullen zoals Extreme Volume.
Veel gebruikte geschikte bodembedekkers zijn kartonsnippers (o.a. Greenmile, BedXcel, Ecobale, Finacard, ..), hennepvezel (Aubiose, Hemperade), papierkorrels (Back2Nature) en stofvrije houtkrullen (Extreme Volume en soortgelijke, de grove krullen, niet gewoon zaagsel). Je kunt in het verblijf een of meerdere (hoek)toiletjes neerzetten met goed absorberende bodembedekking zoals back 2 nature.
In geval van nood kun je ook kranten gebruiken als bodembedekking, de inkt in kranten is al jaren niet meer schadelijk dus gewoon veilig om te gebruiken. Kranten zijn ook erg leuk nestmateriaal, scheur een krant in reepjes of laat de ratten zelf scheuren! Ander nestmateriaal wat je kunt geven zijn kartonslierten, tissues, reepjes fleece, enz. Hooi kan ook, maar leg dit voor gebruik minimaal 48 uur in de diepvries om eventuele parasieten te doden. Ratten eten overigens vrijwel geen hooi, in tegenstelling tot sommige andere knagers.
Verschoon de kooi inclusief de bodembedekking regelmatig. Afhankelijk van het formaat van de kooi en het aantal ratten zul je de kooi vaker of minder vaak moeten schoonmaken. Vaak is een keer per week of een keer per twee weken voldoende. Als je ratten zindelijk zijn kun je tussendoor de toiletjes wat vaker verschonen. Een vieze kooi is niet alleen onprettig voor jezelf maar ook schadelijk voor de gezondheid van je ratten. De ammoniaklucht kan op de longen slaan en zij zitten er met hun gevoelige neus veel dichter op dan wij!
Ratten zijn redelijk goed zindelijk te krijgen, plaats het toiletje op een plaats waar ze graag hun behoefte doen en plaats dagelijks hun keutels er in. Plateaus en vlakbij hun slaapplaats zijn vaak goede plaatsen om een toiletje neer te zetten.
Een gladde platte steen of een omgekeerd schoteltje in het toilet leggen heeft vaak het effect dat ze graag daar plassen.